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肿瘤融合基因研究方案

研究目的:

全面准确的鉴定肿瘤中的基因融合,解析频发基因融合在肿瘤发生、发展过程中的重要作用。

 

技术路线:

 

研究方案:

 

方案特色:

 

经典案例

RNA-seq analysis of  prostate  cancer  in  the  Chinese  population  identifies  recurrent  gene  fusions, cancer-associated long noncoding RNAs and aberrant  alternative splicings.

影响因子:10.52

案例描述:

研究目的
前列腺癌症病人中基因融合现象调查。
研究方法

材料:14个中国前列腺病人组织。

方法:转录组测序。

研究结果

基因融合,长非编码 RNA,可变剪切以及体突变在不同病人中差异很大。

21.4%的患者含有TMPRSS2-ERG 基因融合,在大样本中验证频率为 18.5% (10/54),表明在中国人群中是比较低的。

两个新的基因融合, CTAGE5-KHDRBS3 (20/54=37%) 和USP9Y-TTTY15(19/54=35.2%),在研究的病人中出现的频率较大。

 

(工作日:8:30-17:30)