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 产品介绍

小 RNA 是一类重要的体内调节分子,主要包括 miRNA、piRNA 和 siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,从而调节细胞生长、分化以及个体发育、生殖等重要生物学过程。小 RNA 测序技术采用胶分离技术,收集样品中 18~30nt 的 RNA 片段,利用高通量测序技术,一次性获得单碱基分辨率的数百万条小 RNA 序列信息,依托强大的生物信息分析平台,鉴定已知小RNA,并预测新的小 RNA 及其靶基因。

 

产品参数

测序数据:≥10M reads/样本

样本选择:≥20µg/样本

项目周期:40 个工作日

产品优势:既能鉴定已知小 RNA,又能发现新小 RNA

 

产品流程

 

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【柑橘全爪螨四个时期 Small RNA 分析】

研究材料:柑橘全爪螨胚胎、幼虫、若虫、雌性成虫

研究策略:SE50

研究目的:阐明 Small RNA 在柑橘全爪螨生长中所起的作用,为建立控制该害虫的有效方法提供科学依据

研究结果:鉴定出 594 个已知 miRNA,预测出 31 个候选 miRNA;

差异表达分析发现,已知 miRNA 在幼虫和若虫中的表达量多于胚胎和成虫,表明其与柑橘全爪螨发育有关;

对31个候选miRNA进行靶基因预测, 发现一个miRNA对应900-8000个靶基因。

 

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参考文献:

An analysis of the small RNA transcriptome of four developmental stages of the citrus red mite ( Panonychus citri ). Insect Molecular Biology, 2014.

(工作日:8:30-17:30)