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 产品介绍

单细胞转录组是在单细胞水平对转录组进行测序的一项新技术,原理是将单个细胞的微量mRNA扩增后进行高通量测序。单细胞转录组测序克服了细胞间异质性及原始样本稀少的问题,pg级RNA起始量即可测得细胞的转录组信息。适用于高度异质性细胞以及胚胎发育早期的细胞群体研究,例如追踪病理条件下基因表达动力学变化、揭示胚胎发育过程中细胞分化的基因表达特征以及肿瘤亚克隆细胞间基因表达差异分析。

 

产品参数

测序数据: 6G /样本

样本选择:合作方提供单细胞样品

项目周期:50个工作日

测序策略:Illumina Hiseq PE150

 

产品优势

低起始量:单细胞级别起始量,低至pg 级起始量;

高效扩增:SMART技术保证高敏感、无偏好的cDNA转录本扩增,并能够富集完整全长转录本,维持原始转录本丰度;

丰富项目经验:目前已与国内多家医学科研单位合作进行单细胞测序项目;

 

产品流程

 

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【单细胞转录组揭示CD127+先天淋巴细胞异质性】

研究材料:扁桃体中的先天淋巴细胞(ILCs)和自然杀伤(NK)细胞

研究策略: 单细胞转录组测序,SMART扩增,Illumina HiSeq 2000测序

研究目的:探究先天淋巴细胞间的异质性

研究结果:通过单细胞转录组测序技术并应用PCA及t-SNE等方法对ILC中847个表达的基因进行聚类分析,将细胞主要分为4类:ILC1、ILC2、ILC3及NK 细胞。对这4类细胞亚群的进行表达特征分析,发现3类ILCs中共有的差异表达基因比NK细胞中要高,并对其特有的表达基因及转录因子进行分析。此外,研究者也发现了ILC1细胞有79个表达量显著上调基因;ILC2细胞58个表达量显著上调的基因;而在ILC3细胞中有371个表达量显著上调的基因,根据表达特征将ILC3细胞分为3个亚型:ClusterA、ClusterB、ClusterC, 通过对这3种亚型细胞的分析,发现了新的免疫细胞CD62L+ILC3。本研究共对648个单细胞进行单细胞转录组的分析,探究了不同类型间的ILCs表达特征及差异表达基因,为人类CD127+ILC的研究奠定基础。

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参考文献:

The heterogeneity of human CD127+ innate lymphoid cells revealed by single-cell RNA sequencing.Nature Immunology,2016.

(工作日:8:30-17:30)