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 产品介绍

三代基因组是指同时利用二代测序和三代测序平台, 对未知基因组物种进行测序,通过壹基因自主研发的组装软件 HABOT(Hybrid Assembly Based on TGS)进行混合拼接、组装,从而获得该物种高质量的基因组序列图谱,目前已成为基因组 组装方法的大趋势。

 

产品参数

样本准备:≥1mg DNA      组装指标: 简单基因组 Contig N50≥200kb Scaffold N50≥1Mb

项目周期:180 个工作日   组装指标:复杂基因组 Contig N50≥60kb Scaffold N50≥300kb

产品优势:壹基因自主研发软件,提升基因组组装效果卓越,且有丰富的在线项目经验。

 

产品流程

 

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【HABOT软件内部测试结果】

研究材料:人数据

研究策略:Illumina 120 X+ Pacbio 10 X

研究目的:测试 HABOT 软件组装效果

研究结果:Contig N50 279kb,Scaffold N50 1M,具体见下表

 

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参考文献:

Chengxi Ye. DBG2OLC: Efficient Assembly of Large Genomes Using the Compressed Overlap Graph. 2014.

(工作日:8:30-17:30)