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 产品介绍

无参转录组测序分析是指在不需要物种基因组详细信息的情况下, 用新一代高通量测序技术对某物种的特定组织/细胞或个体的转录本进行测序, 用相应的软件进行转录本的组装,得到相关样本的基因表达信息,以及样本间差异表达信息。

 

产品参数

测序数据:≥6G/样本

样本选择:5µg/样本,建议≥3 个生物学重复

项目周期:50个工作日

产品优势:可分析无参考基因组物种的基因表达

 

产品流程

 

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【秦艽转录组测序分析裂环烯醚萜合成途径 】

研究材料:秦艽新鲜植物组织-花、茎、叶、根部分

研究策略:转录组 和表达谱,PE91、SE50

研究目的:研究秦艽有效药用成分分子生物学机制

研究结果:获得 42,918 条 unigenes,平均长度为 667 bp;

2,339 条 unigenes 参与生长发育的次生代谢途径,其中 114 条 unigene 参与环烯醚萜合成代谢;

与拟南芥基因组序列比对,发现 4,413unigenes 与拟南芥转录因子同源。

 

 

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参考文献:

An insight into the genes involved in secoiridoid biosynthesis in Gentiana macrophylla by RNA. Molecular Biology Reports, 2014.

(工作日:8:30-17:30)