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 产品介绍

RAD-seq 遗传图谱是通过特定酶对基因组进行酶切,对获得的 RAD tag 进行高通量测序,获得大量 SNP 信息,构建高密度遗传图谱, 并且结合表型数据,进行 QTL 定位。高通量测序构建的遗传图谱与传统标记(如 AFLP、SSR 等)构建的图谱相比, 能够找出位置序列的 SNP 位点,且图谱分辨率更高,QTL 定位更准。

RAD-Seq 大幅降低基因组的复杂度,操作简便,同时不受有无参考基因组序列的限制,是一种经济、快速的研究手段。

 

产品参数

项目周期:60个工作日

测序策略:≥3X/亲本;≥1.2X/子代;≥100 个体(F1/F2/RILs/BC 等)

样本准备:3µg/样本,作图群体

产品优势:有无参考基因组序列均可,构建高密度图谱

 

产品流程

 

RAD-seq-yichuantupu-fenxi-1

【用RAD-Seq的方法构建葡萄高密度遗传图谱】

研究材料:“Z180”与“Beihong”杂交F1代,共计100个样本

研究策略:~ 16G raw data

研究目的:用经济快速的方法构建葡萄遗传图谱和 QTL 定位,促进育种应用

研究结果:构建了一个含 1,814 个高质量 SNP 标记的图谱,用于后续 QTL 定位。

 

RAD-seq-yichuantupu-fenxi-2
 

参考文献:

Construction of a high-density genetic map for grape using next generation restriction-site associated DNA sequencing. BMC Plant Biology, 2012.

(工作日:8:30-17:30)