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 产品介绍

个体重测序是指对已经发表参考基因组的物种进行全基因组重测序。基于与参考序列的比对信息,能快速、精准的得到大量SNP、InDel、SV、CNV等遗传多态性信息,以揭示个体间的表型多态性背后的分子机制,为后续功能研究提供理论依据。

 

产品参数

样本准备:3µg/样本

测序策略:10-30X

项目周期:30个工作日

产品优势:获得个体序列差异,分析遗传多态性

 

产品流程

 

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 【自身免疫白癜风SL鸡群基因组重测序分析】 

研究材料:白癜风(SL)鸡群和非白癜风(BL)鸡群各10只

研究策略:SL鸡和BL鸡各10只混池,分别用Illumina测序5.1x和7.0x

研究目的:通过自身免疫性白癜风动物模型(SL)鸡重测序研究人类白癜风的遗传基础

研究结果:检测到156个高可信度的SNP位点导致了蛋白质的非同义、同义、移码和非起始点突变;随机选择14个SNP在SL鸡群和BL鸡群中用PCR扩增,验证发现,两个群体中存在很多差异表达基因;

对139个差异表达基因的研究发现这些基因与皮肤病基因相关,包括:ADAMTS13ASPMATP6V0A2BRCA2COL12A1GRM5LRP2OBSCNPLAURNF168STAB2XIRP1;这些候选基因在蛋白激酶网络、磷酸酶网络、泛素化网络和淀粉样蛋白生产网络中心起作用。

 

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参考文献:

Genome resequencing and bioinformatic analysis of SNP containing candidate genes in the autoimmune vitiligo Smyth line chicken model. BMC Genomics, 2014.

(工作日:8:30-17:30)