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 产品介绍

自然发生的遗传变异如何影响基因表达水平是在分子水平上解析复杂性状的第一步。 表达数量性状基因座位(expression QTL,eQTL)通过对分离群体基因分型和每个个体基因表达量分析, 对影响或关联基因表达水平的所有基因组区域进行定位, 从而实现对复杂性状候选基因的定位及调控网络的构建,是研究基因表达调控的首选方法。

 

产品参数

测序数据:≥6G/样本

样本选择:5µg/样本、建议≥100 个作图群体

项目周期:120 个工作日

产品优势:精细地定位候选基因,构建调控网络

 

产品流程

 

eQTL-Mapping-1

【eQTL研究玉米籽粒发育基因调控网络】

研究材料:368 株玉米近交系籽粒,授粉后 15 天取样

研究策略:6.3G/个体

研究目的:研究玉米籽粒发育关键基因和调控网络

研究结果:鉴定出 16,408 个 eQTLs,其中 55.2%是 local-eQTLs( cis -eQTLs) ,44.8%是distant-eQTLs( trans -eQTLs);使用两步法将 95.1%的 eQTLs 定位到 10kb 的区域中, 其中 67.7%的区域只含一个基因。揭示调控玉米籽粒发育的候选基因, 并构建了相关基因调控网络,包括 31 个玉米蛋白基因和 16 个关键谷粒基因。这些结果为研究玉米发育和提高玉米产量与品质提供了大量有效数据。

 

eQTL-Mapping-2

 

参考文献:

RNA sequencing reveals the complex regulatory network in the maize kernel. Nature

Communications, 2013.

(工作日:8:30-17:30)