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基因组de novo 研究

 

基因组de novo也叫从头测序,在不需要任何参考序列信息情况下,对某个物种进行基因组测序, 并用生物信息分析的方法进行拼接、 组装, 从而获得该物种的基因组序列图谱。

 

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1953年,沃森和克里克发现了DNA双螺旋结构,标志着人类对基因的研究从实验观察统计阶段步入了分子生物学阶段。自Sanger测序技术的发明,使得基因序列可视化成为可能,进而推动了各物种基因组图谱测序大爆发。

 

人类全基因组序列的发表,以及利用NGS测序技术完成的1000Genomes计划,奠定了今日如火如荼的个性化医疗分析的基础。小麦、水稻、土豆等大田作物基因组的发表,使得全基因组GWAS分析精准定位与农艺性状相关的候选基因越来越高效,分子育种正在变成和传统杂交育种同等甚至更重要的手段。

 

向仲怀院士曾预言:“一个物种基因组计划的完成,就意味着这一物种学科和产业发展的新开端”,而这已经变成现实。

 

壹基因的核心团队成员具有平均5年以上的基因组分析经验,且从NGS应用于基因组研究发轫之初,即参与其中,是基因组研究的跟随者和领导者,对基因组研究的过去,现在和未来有着深刻体会和精准把握。同时,壹基因牢记自己的使命—“让客户没有难用的数据”,投入了大量的资源致力于基因组组装软件的研发,目前已推出基于二代和三代测序数据混合组装软件HABOT,并在若干个项目中获得卓越效果,解决了单纯基于NGS数据基因组组装中contig偏短的难题。基因组研究,壹基因always keep going!

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