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 产品介绍

驯化位点混池重测序分析是针对不同的品种/品系,通过群体内 pooling 建库的方法,进行全基因组重测序, 采用生物信息学方法进行全基因组范围内变异位点扫描,并进行选择性清除分析(Selective Sweeps),结合相关区域的基因功能注释信息,挖掘驯化相关的基因,剖析动植物的驯化条件、驯化过程及其进化动力。

 

产品参数

项目周期:50 个工作日

测序策略:≥30X/混池(品系)

样本选择:3µg/混池,≥10 个体/混池(品系)

产品优势:无需构建群体,低成本

 

产品流程

 

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【狗与狼的驯化位点分析】

研究材料:分布于世界各地的7个品系的狼,14个品系的狗

研究策略:对12只狼的DNA样本进行pooling测序,深度为6.2X;

对60只狗的DNA样本进行pooling测序,测序深度为29.8X

研究目的:对狗和狼进行了全基因组测序,探寻狗驯化过程中的关键遗传因素

研究结果:识别了 380 万个遗传变异位点;

在狗的基因组中共发现 36 个明显受驯化选择的区域,包含 122 个基因;

其中 19 个与脑发育相关的基因、3 个与精子受精过程竞争相关的基因、10 个与淀粉和脂肪代谢相关的基因。

 

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参考文献:

The genomic signature of dog domestication reveals adaptation to a starch-rich diet . Nature, 2013.

(工作日:8:30-17:30)